大脑打印计划 🧠
主要参考 | How I Converted my Brain fMRI to a 3D Model
大脑数据来源？
这需要你大脑的核磁共振扫描数据，推荐是关注周边高校和研究机构，有没有招被试的核磁实验，和实验者🥼沟通沟通，比如说希望试验结束能获得自己大脑的核磁数据。医院的核磁扫描是否能要到数据，目前我不了解。
如果对面做了后续处理，可以试着要T1像的nii.gz格式数据，就可以跳过后面数据格式转换，如果要到的是原始数据，虽说可以通过dicombrowser 查看数据信息，但还是推荐询问实验者哪些是T1像。
我的数据是3T场强的核磁扫出来了的，场强越大越精细，对3D打印模型精度影响不大，主要是可以通过建模软件对模型进行细分和平滑。
数据转换 | 学习 FreeSurfer 和熟悉 fMRI 数据格式
先是在子系统里，用cd /mnt/e切换到E盘，mkdir freesurfer,cd进去下载和安装软件。可在此找符合电脑版本的安装包
wget https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/pub/dist/freesurfer/7.2.0/freesurfer-linux-ubuntu18_amd64-7.2.0.tar.gz
tar -zxv -f freesurfer-linux-ubuntu18_amd64-7.2.0.tar.gz #解压缩
需要在FreeSurfer Download and Registration中先注册，为的是获得license.txt，可能会显示FreeSurfer Registration Error reCAPTCHA not checked ,谷歌的人机验证reCAPTCHA无法正常使用，可以按照浏览器插件gooreplacer可以解决reCaptcha验证码无法加载的问题的方法解决（edge也有该插件），将license.txt放到./freesurfer。
sudo chmod -R 777 ./freesurfer #改变freesurfer的权限
vi ~/.bashrc
# 在~/.bashrc文件中添加以下两行
export FREESURFER_HOME= 你滴路径
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh
source ~/.bashrc
sudo apt-get install tcsh #安装tcsh，类似与bash，不安装运行的时候会报错，相关资料是真滴少
recol-all --help #最后查看是否安装成功
关于数据 ： 我获得的数据的格式全部为IMA格式，.ima是西门子ct设备生成的医学图像文件格式之一，和.dicm文件格式一样（是二维的多张图像），数据是原始的下机数据。参考中他直接上手的数据是.nii.gz格式，是二进制压缩的NIFTI文件（三维图像），需要进行处理才能得到。
sudo apt install dcm2niix
# 装一个转换用的包
sudo apt-get install pigz
# 按一个加速的支持
dcm2niix -o my_brain -f my_brain -z y brain_data/
# 输出文件夹 | 输出文件名,格式.nii.gz | 输入数据文件夹
先试试 gif_your_nifti 看看生成的gif结果如何，也是确保自己选的是否是T1的结构像。
git clone https://github.com/miykael/gif_your_nifti
cd gif_your_nifti
pip3 install -r requirements.txt #安装所需的py包，可以自己看一眼有没有没装的
python3 setup.py install #好习惯是激活个虚拟环境
# 转换，gif文件在输入文件的文件夹里生成， 可以看示例中的gif 调--cmap
gif_your_nifti ../my_brain/my_brain.nii.gz --mode pseudocolor --cmap viridis
剥头皮，获得 stl 导入blender
之后是使用freesurfer，进行漫长的剥头皮。（推荐过夜跑，我跑到快凌晨5点才弄完）
mkdir -p subjects
export SUBJECTS_DIR=$(pwd)/subjects
recon-all -i 你滴.nii.gz -s 输出文件夹名字 -all
surf，输入以下命令转化为stl格式，用blender打开。
mris_convert lh.pial lh.pial.stl
mris_convert rh.pial rh.pial.stl
Part 1 | 联系3D打印农场
某群友推荐 wenext ，材料是树脂的话，价格0.3元/g，淘宝联系客服后加微信发了stl模型文件（记得将两半脑合并为一个stl导出，缩放选择0.001即是1：1大小 || 补：blender读取stl单位是m，那边的工业软件读取stl文件的单位是mm，所以不用放缩，具体和做3D打印的问问）
我的1:1大脑参数如下
Part 2 | 玩耍
展示
✧*｡٩(ˊᗜˋ*)و✧*｡ 希望能在评论区看到大伙的大脑模型 🎉